Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC6A13Q9NSD5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms