Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNX15Q9NRS6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms