Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRQ5

SMCO4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO4Q9NRQ5 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMCO4Q9NRQ5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMCO4Q9NRQ5 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMCO4Q9NRQ5 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMCO4Q9NRQ5 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMCO4Q9NRQ5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMCO4Q9NRQ5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMCO4Q9NRQ5 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMCO4Q9NRQ5 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMCO4Q9NRQ5 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMCO4Q9NRQ5 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMCO4Q9NRQ5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMCO4Q9NRQ5 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMCO4Q9NRQ5 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMCO4Q9NRQ5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMCO4Q9NRQ5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMCO4Q9NRQ5 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMCO4Q9NRQ5 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMCO4Q9NRQ5 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMCO4Q9NRQ5 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMCO4Q9NRQ5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMCO4Q9NRQ5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMCO4Q9NRQ5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SMCO4Q9NRQ5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMCO4Q9NRQ5 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMCO4Q9NRQ5 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMCO4Q9NRQ5 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMCO4Q9NRQ5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMCO4Q9NRQ5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMCO4Q9NRQ5 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMCO4Q9NRQ5 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMCO4Q9NRQ5 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMCO4Q9NRQ5 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMCO4Q9NRQ5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMCO4Q9NRQ5 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMCO4Q9NRQ5 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMCO4Q9NRQ5 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMCO4Q9NRQ5 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMCO4Q9NRQ5 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMCO4Q9NRQ5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMCO4Q9NRQ5 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMCO4Q9NRQ5 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMCO4Q9NRQ5 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMCO4Q9NRQ5 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMCO4Q9NRQ5 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMCO4Q9NRQ5 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMCO4Q9NRQ5 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMCO4Q9NRQ5 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMCO4Q9NRQ5 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMCO4Q9NRQ5 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMCO4Q9NRQ5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SMCO4Q9NRQ5 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMCO4Q9NRQ5 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMCO4Q9NRQ5 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMCO4Q9NRQ5 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMCO4Q9NRQ5 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMCO4Q9NRQ5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMCO4Q9NRQ5 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMCO4Q9NRQ5 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMCO4Q9NRQ5 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMCO4Q9NRQ5 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMCO4Q9NRQ5 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMCO4Q9NRQ5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMCO4Q9NRQ5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMCO4Q9NRQ5 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMCO4Q9NRQ5 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMCO4Q9NRQ5 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMCO4Q9NRQ5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMCO4Q9NRQ5 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMCO4Q9NRQ5 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMCO4Q9NRQ5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMCO4Q9NRQ5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMCO4Q9NRQ5 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMCO4Q9NRQ5 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMCO4Q9NRQ5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMCO4Q9NRQ5 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMCO4Q9NRQ5 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMCO4Q9NRQ5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMCO4Q9NRQ5 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMCO4Q9NRQ5 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMCO4Q9NRQ5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMCO4Q9NRQ5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMCO4Q9NRQ5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMCO4Q9NRQ5 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SMCO4Q9NRQ5 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMCO4Q9NRQ5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMCO4Q9NRQ5 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMCO4Q9NRQ5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMCO4Q9NRQ5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMCO4Q9NRQ5 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMCO4Q9NRQ5 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMCO4Q9NRQ5 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMCO4Q9NRQ5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMCO4Q9NRQ5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMCO4Q9NRQ5 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMCO4Q9NRQ5 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMCO4Q9NRQ5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMCO4Q9NRQ5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SMCO4Q9NRQ5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMCO4Q9NRQ5 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms