Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR96

TLR9, Toll-like receptor 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR9Q9NR96 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TLR9Q9NR96 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms