Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR12

PDLIM7, PDZ and LIM domain protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM7Q9NR12 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDLIM7Q9NR12 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms