Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW8

CNGB3, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB3Q9NQW8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNGB3Q9NQW8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms