Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYLDQ9NQC7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYLDQ9NQC7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms