Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms