Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC8

SIX2, Homeobox protein SIX2, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX2Q9NPC8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIX2Q9NPC8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIX2Q9NPC8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIX2Q9NPC8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIX2Q9NPC8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIX2Q9NPC8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIX2Q9NPC8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SIX2Q9NPC8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SIX2Q9NPC8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIX2Q9NPC8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIX2Q9NPC8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIX2Q9NPC8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIX2Q9NPC8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIX2Q9NPC8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIX2Q9NPC8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIX2Q9NPC8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIX2Q9NPC8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIX2Q9NPC8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIX2Q9NPC8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIX2Q9NPC8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIX2Q9NPC8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIX2Q9NPC8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIX2Q9NPC8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SIX2Q9NPC8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIX2Q9NPC8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIX2Q9NPC8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIX2Q9NPC8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIX2Q9NPC8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIX2Q9NPC8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIX2Q9NPC8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIX2Q9NPC8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIX2Q9NPC8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIX2Q9NPC8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIX2Q9NPC8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIX2Q9NPC8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIX2Q9NPC8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIX2Q9NPC8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIX2Q9NPC8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIX2Q9NPC8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIX2Q9NPC8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SIX2Q9NPC8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIX2Q9NPC8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIX2Q9NPC8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SIX2Q9NPC8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIX2Q9NPC8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIX2Q9NPC8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIX2Q9NPC8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIX2Q9NPC8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIX2Q9NPC8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIX2Q9NPC8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIX2Q9NPC8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIX2Q9NPC8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIX2Q9NPC8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIX2Q9NPC8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIX2Q9NPC8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIX2Q9NPC8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIX2Q9NPC8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIX2Q9NPC8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIX2Q9NPC8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIX2Q9NPC8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIX2Q9NPC8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIX2Q9NPC8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIX2Q9NPC8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIX2Q9NPC8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIX2Q9NPC8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SIX2Q9NPC8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIX2Q9NPC8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIX2Q9NPC8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIX2Q9NPC8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIX2Q9NPC8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIX2Q9NPC8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIX2Q9NPC8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIX2Q9NPC8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIX2Q9NPC8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIX2Q9NPC8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIX2Q9NPC8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIX2Q9NPC8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIX2Q9NPC8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIX2Q9NPC8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SIX2Q9NPC8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIX2Q9NPC8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIX2Q9NPC8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIX2Q9NPC8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIX2Q9NPC8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIX2Q9NPC8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIX2Q9NPC8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIX2Q9NPC8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIX2Q9NPC8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SIX2Q9NPC8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIX2Q9NPC8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIX2Q9NPC8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SIX2Q9NPC8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIX2Q9NPC8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIX2Q9NPC8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIX2Q9NPC8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIX2Q9NPC8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIX2Q9NPC8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIX2Q9NPC8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIX2Q9NPC8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SIX2Q9NPC8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms