Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBW1

LRRC4, Leucine-rich repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4Q9HBW1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LRRC4Q9HBW1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms