Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
UPF2Q9HAU5 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UPF2Q9HAU5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UPF2Q9HAU5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UPF2Q9HAU5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UPF2Q9HAU5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UPF2Q9HAU5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UPF2Q9HAU5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UPF2Q9HAU5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
UPF2Q9HAU5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UPF2Q9HAU5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UPF2Q9HAU5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UPF2Q9HAU5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UPF2Q9HAU5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UPF2Q9HAU5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UPF2Q9HAU5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UPF2Q9HAU5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UPF2Q9HAU5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UPF2Q9HAU5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UPF2Q9HAU5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UPF2Q9HAU5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UPF2Q9HAU5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UPF2Q9HAU5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UPF2Q9HAU5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UPF2Q9HAU5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UPF2Q9HAU5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UPF2Q9HAU5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UPF2Q9HAU5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UPF2Q9HAU5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UPF2Q9HAU5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UPF2Q9HAU5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UPF2Q9HAU5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UPF2Q9HAU5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UPF2Q9HAU5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
UPF2Q9HAU5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
UPF2Q9HAU5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UPF2Q9HAU5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UPF2Q9HAU5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UPF2Q9HAU5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UPF2Q9HAU5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UPF2Q9HAU5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UPF2Q9HAU5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UPF2Q9HAU5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UPF2Q9HAU5 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UPF2Q9HAU5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UPF2Q9HAU5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UPF2Q9HAU5 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UPF2Q9HAU5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
UPF2Q9HAU5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UPF2Q9HAU5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UPF2Q9HAU5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UPF2Q9HAU5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UPF2Q9HAU5 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UPF2Q9HAU5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UPF2Q9HAU5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UPF2Q9HAU5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UPF2Q9HAU5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UPF2Q9HAU5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UPF2Q9HAU5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UPF2Q9HAU5 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UPF2Q9HAU5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UPF2Q9HAU5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UPF2Q9HAU5 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UPF2Q9HAU5 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UPF2Q9HAU5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UPF2Q9HAU5 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UPF2Q9HAU5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UPF2Q9HAU5 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UPF2Q9HAU5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UPF2Q9HAU5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UPF2Q9HAU5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UPF2Q9HAU5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UPF2Q9HAU5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UPF2Q9HAU5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UPF2Q9HAU5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UPF2Q9HAU5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UPF2Q9HAU5 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UPF2Q9HAU5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UPF2Q9HAU5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UPF2Q9HAU5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UPF2Q9HAU5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UPF2Q9HAU5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UPF2Q9HAU5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UPF2Q9HAU5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UPF2Q9HAU5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UPF2Q9HAU5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UPF2Q9HAU5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
UPF2Q9HAU5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
UPF2Q9HAU5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
UPF2Q9HAU5 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UPF2Q9HAU5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UPF2Q9HAU5 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UPF2Q9HAU5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UPF2Q9HAU5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UPF2Q9HAU5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UPF2Q9HAU5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UPF2Q9HAU5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UPF2Q9HAU5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UPF2Q9HAU5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
UPF2Q9HAU5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms