Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NRDE2Q9H7Z3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NRDE2Q9H7Z3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NRDE2Q9H7Z3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NRDE2Q9H7Z3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NRDE2Q9H7Z3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NRDE2Q9H7Z3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NRDE2Q9H7Z3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NRDE2Q9H7Z3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NRDE2Q9H7Z3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NRDE2Q9H7Z3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NRDE2Q9H7Z3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NRDE2Q9H7Z3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NRDE2Q9H7Z3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NRDE2Q9H7Z3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NRDE2Q9H7Z3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NRDE2Q9H7Z3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NRDE2Q9H7Z3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NRDE2Q9H7Z3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NRDE2Q9H7Z3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NRDE2Q9H7Z3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NRDE2Q9H7Z3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NRDE2Q9H7Z3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NRDE2Q9H7Z3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NRDE2Q9H7Z3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NRDE2Q9H7Z3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NRDE2Q9H7Z3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NRDE2Q9H7Z3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NRDE2Q9H7Z3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NRDE2Q9H7Z3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NRDE2Q9H7Z3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NRDE2Q9H7Z3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NRDE2Q9H7Z3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NRDE2Q9H7Z3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NRDE2Q9H7Z3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NRDE2Q9H7Z3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NRDE2Q9H7Z3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NRDE2Q9H7Z3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NRDE2Q9H7Z3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NRDE2Q9H7Z3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NRDE2Q9H7Z3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NRDE2Q9H7Z3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NRDE2Q9H7Z3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NRDE2Q9H7Z3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NRDE2Q9H7Z3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NRDE2Q9H7Z3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NRDE2Q9H7Z3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NRDE2Q9H7Z3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NRDE2Q9H7Z3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NRDE2Q9H7Z3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NRDE2Q9H7Z3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NRDE2Q9H7Z3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NRDE2Q9H7Z3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NRDE2Q9H7Z3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NRDE2Q9H7Z3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NRDE2Q9H7Z3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NRDE2Q9H7Z3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NRDE2Q9H7Z3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NRDE2Q9H7Z3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NRDE2Q9H7Z3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NRDE2Q9H7Z3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NRDE2Q9H7Z3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NRDE2Q9H7Z3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NRDE2Q9H7Z3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NRDE2Q9H7Z3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NRDE2Q9H7Z3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NRDE2Q9H7Z3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NRDE2Q9H7Z3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NRDE2Q9H7Z3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NRDE2Q9H7Z3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NRDE2Q9H7Z3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NRDE2Q9H7Z3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NRDE2Q9H7Z3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NRDE2Q9H7Z3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NRDE2Q9H7Z3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NRDE2Q9H7Z3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NRDE2Q9H7Z3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NRDE2Q9H7Z3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NRDE2Q9H7Z3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NRDE2Q9H7Z3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NRDE2Q9H7Z3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NRDE2Q9H7Z3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NRDE2Q9H7Z3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NRDE2Q9H7Z3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NRDE2Q9H7Z3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms