Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6T3

RPAP3, RNA polymerase II-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP3Q9H6T3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPAP3Q9H6T3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPAP3Q9H6T3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms