Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6R3

ACSS3, Acyl-CoA synthetase short-chain family member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS3Q9H6R3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ACSS3Q9H6R3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms