Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B9

EPHX3, Epoxide hydrolase 3, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHX3Q9H6B9 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHX3Q9H6B9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHX3Q9H6B9 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHX3Q9H6B9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHX3Q9H6B9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHX3Q9H6B9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHX3Q9H6B9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHX3Q9H6B9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHX3Q9H6B9 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms