Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRDM12Q9H4Q4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRDM12Q9H4Q4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRDM12Q9H4Q4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRDM12Q9H4Q4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRDM12Q9H4Q4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRDM12Q9H4Q4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRDM12Q9H4Q4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRDM12Q9H4Q4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
PRDM12Q9H4Q4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms