Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDCL3Q9H2J4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDCL3Q9H2J4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms