Protein–RNA interactions for Protein: Q9H269

VPS16, Vacuolar protein sorting-associated protein 16 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS16Q9H269 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS16Q9H269 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS16Q9H269 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS16Q9H269 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS16Q9H269 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS16Q9H269 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS16Q9H269 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS16Q9H269 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS16Q9H269 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS16Q9H269 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS16Q9H269 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS16Q9H269 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS16Q9H269 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS16Q9H269 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS16Q9H269 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS16Q9H269 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS16Q9H269 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS16Q9H269 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS16Q9H269 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS16Q9H269 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS16Q9H269 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS16Q9H269 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS16Q9H269 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS16Q9H269 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS16Q9H269 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS16Q9H269 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS16Q9H269 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS16Q9H269 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS16Q9H269 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VPS16Q9H269 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VPS16Q9H269 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VPS16Q9H269 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VPS16Q9H269 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VPS16Q9H269 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VPS16Q9H269 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VPS16Q9H269 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VPS16Q9H269 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VPS16Q9H269 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VPS16Q9H269 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS16Q9H269 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS16Q9H269 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS16Q9H269 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS16Q9H269 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS16Q9H269 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS16Q9H269 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS16Q9H269 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS16Q9H269 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS16Q9H269 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS16Q9H269 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS16Q9H269 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS16Q9H269 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS16Q9H269 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS16Q9H269 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS16Q9H269 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS16Q9H269 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS16Q9H269 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS16Q9H269 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS16Q9H269 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS16Q9H269 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS16Q9H269 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS16Q9H269 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS16Q9H269 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS16Q9H269 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS16Q9H269 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS16Q9H269 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS16Q9H269 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS16Q9H269 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS16Q9H269 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS16Q9H269 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS16Q9H269 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS16Q9H269 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS16Q9H269 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS16Q9H269 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS16Q9H269 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS16Q9H269 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS16Q9H269 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS16Q9H269 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS16Q9H269 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS16Q9H269 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS16Q9H269 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS16Q9H269 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS16Q9H269 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS16Q9H269 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS16Q9H269 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS16Q9H269 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS16Q9H269 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS16Q9H269 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS16Q9H269 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS16Q9H269 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS16Q9H269 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS16Q9H269 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS16Q9H269 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS16Q9H269 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS16Q9H269 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS16Q9H269 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS16Q9H269 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS16Q9H269 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS16Q9H269 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS16Q9H269 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS16Q9H269 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms