Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0I3

CCDC113, Coiled-coil domain-containing protein 113, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC113Q9H0I3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC113Q9H0I3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms