Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NYXQ9GZU5 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NYXQ9GZU5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NYXQ9GZU5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NYXQ9GZU5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NYXQ9GZU5 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NYXQ9GZU5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NYXQ9GZU5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NYXQ9GZU5 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NYXQ9GZU5 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NYXQ9GZU5 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NYXQ9GZU5 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NYXQ9GZU5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NYXQ9GZU5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NYXQ9GZU5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NYXQ9GZU5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NYXQ9GZU5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NYXQ9GZU5 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NYXQ9GZU5 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NYXQ9GZU5 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NYXQ9GZU5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NYXQ9GZU5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NYXQ9GZU5 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NYXQ9GZU5 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NYXQ9GZU5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NYXQ9GZU5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NYXQ9GZU5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NYXQ9GZU5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NYXQ9GZU5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NYXQ9GZU5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NYXQ9GZU5 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NYXQ9GZU5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NYXQ9GZU5 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NYXQ9GZU5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NYXQ9GZU5 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NYXQ9GZU5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NYXQ9GZU5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NYXQ9GZU5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NYXQ9GZU5 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NYXQ9GZU5 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NYXQ9GZU5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NYXQ9GZU5 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NYXQ9GZU5 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
NYXQ9GZU5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NYXQ9GZU5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NYXQ9GZU5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NYXQ9GZU5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NYXQ9GZU5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NYXQ9GZU5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NYXQ9GZU5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NYXQ9GZU5 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NYXQ9GZU5 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NYXQ9GZU5 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NYXQ9GZU5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NYXQ9GZU5 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
NYXQ9GZU5 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
NYXQ9GZU5 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NYXQ9GZU5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NYXQ9GZU5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NYXQ9GZU5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NYXQ9GZU5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NYXQ9GZU5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NYXQ9GZU5 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NYXQ9GZU5 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NYXQ9GZU5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NYXQ9GZU5 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NYXQ9GZU5 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NYXQ9GZU5 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NYXQ9GZU5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NYXQ9GZU5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NYXQ9GZU5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NYXQ9GZU5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NYXQ9GZU5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NYXQ9GZU5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NYXQ9GZU5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NYXQ9GZU5 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NYXQ9GZU5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NYXQ9GZU5 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NYXQ9GZU5 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NYXQ9GZU5 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NYXQ9GZU5 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NYXQ9GZU5 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NYXQ9GZU5 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NYXQ9GZU5 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NYXQ9GZU5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NYXQ9GZU5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NYXQ9GZU5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NYXQ9GZU5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NYXQ9GZU5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NYXQ9GZU5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NYXQ9GZU5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NYXQ9GZU5 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NYXQ9GZU5 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NYXQ9GZU5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NYXQ9GZU5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NYXQ9GZU5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NYXQ9GZU5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NYXQ9GZU5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NYXQ9GZU5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NYXQ9GZU5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms