Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU3

TMEM39B, Transmembrane protein 39B, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM39BQ9GZU3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM39BQ9GZU3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM39BQ9GZU3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM39BQ9GZU3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM39BQ9GZU3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM39BQ9GZU3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM39BQ9GZU3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM39BQ9GZU3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM39BQ9GZU3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM39BQ9GZU3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM39BQ9GZU3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM39BQ9GZU3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM39BQ9GZU3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM39BQ9GZU3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM39BQ9GZU3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM39BQ9GZU3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM39BQ9GZU3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM39BQ9GZU3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM39BQ9GZU3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM39BQ9GZU3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM39BQ9GZU3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM39BQ9GZU3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM39BQ9GZU3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM39BQ9GZU3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM39BQ9GZU3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM39BQ9GZU3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM39BQ9GZU3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM39BQ9GZU3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM39BQ9GZU3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM39BQ9GZU3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM39BQ9GZU3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM39BQ9GZU3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM39BQ9GZU3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM39BQ9GZU3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM39BQ9GZU3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM39BQ9GZU3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM39BQ9GZU3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM39BQ9GZU3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM39BQ9GZU3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM39BQ9GZU3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM39BQ9GZU3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM39BQ9GZU3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM39BQ9GZU3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM39BQ9GZU3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM39BQ9GZU3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM39BQ9GZU3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM39BQ9GZU3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM39BQ9GZU3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM39BQ9GZU3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM39BQ9GZU3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM39BQ9GZU3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM39BQ9GZU3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM39BQ9GZU3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM39BQ9GZU3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM39BQ9GZU3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM39BQ9GZU3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM39BQ9GZU3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM39BQ9GZU3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM39BQ9GZU3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM39BQ9GZU3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM39BQ9GZU3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM39BQ9GZU3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM39BQ9GZU3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM39BQ9GZU3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM39BQ9GZU3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM39BQ9GZU3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM39BQ9GZU3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM39BQ9GZU3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM39BQ9GZU3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM39BQ9GZU3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM39BQ9GZU3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM39BQ9GZU3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM39BQ9GZU3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM39BQ9GZU3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM39BQ9GZU3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM39BQ9GZU3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM39BQ9GZU3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM39BQ9GZU3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM39BQ9GZU3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM39BQ9GZU3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM39BQ9GZU3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM39BQ9GZU3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM39BQ9GZU3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM39BQ9GZU3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM39BQ9GZU3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM39BQ9GZU3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM39BQ9GZU3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM39BQ9GZU3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM39BQ9GZU3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM39BQ9GZU3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM39BQ9GZU3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM39BQ9GZU3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM39BQ9GZU3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM39BQ9GZU3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM39BQ9GZU3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM39BQ9GZU3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM39BQ9GZU3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM39BQ9GZU3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM39BQ9GZU3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM39BQ9GZU3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms