Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D7

ZC3H12C, Probable ribonuclease ZC3H12C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12CQ9C0D7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZC3H12CQ9C0D7 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZC3H12CQ9C0D7 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZC3H12CQ9C0D7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZC3H12CQ9C0D7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ZC3H12CQ9C0D7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZC3H12CQ9C0D7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZC3H12CQ9C0D7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ZC3H12CQ9C0D7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ZC3H12CQ9C0D7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZC3H12CQ9C0D7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZC3H12CQ9C0D7 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ZC3H12CQ9C0D7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ZC3H12CQ9C0D7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZC3H12CQ9C0D7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZC3H12CQ9C0D7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZC3H12CQ9C0D7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZC3H12CQ9C0D7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZC3H12CQ9C0D7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZC3H12CQ9C0D7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZC3H12CQ9C0D7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZC3H12CQ9C0D7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZC3H12CQ9C0D7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZC3H12CQ9C0D7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZC3H12CQ9C0D7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ZC3H12CQ9C0D7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZC3H12CQ9C0D7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZC3H12CQ9C0D7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZC3H12CQ9C0D7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZC3H12CQ9C0D7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ZC3H12CQ9C0D7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZC3H12CQ9C0D7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZC3H12CQ9C0D7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZC3H12CQ9C0D7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ZC3H12CQ9C0D7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ZC3H12CQ9C0D7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ZC3H12CQ9C0D7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZC3H12CQ9C0D7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ZC3H12CQ9C0D7 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
ZC3H12CQ9C0D7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ZC3H12CQ9C0D7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZC3H12CQ9C0D7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZC3H12CQ9C0D7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZC3H12CQ9C0D7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZC3H12CQ9C0D7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZC3H12CQ9C0D7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZC3H12CQ9C0D7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZC3H12CQ9C0D7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZC3H12CQ9C0D7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZC3H12CQ9C0D7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZC3H12CQ9C0D7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZC3H12CQ9C0D7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZC3H12CQ9C0D7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZC3H12CQ9C0D7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZC3H12CQ9C0D7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZC3H12CQ9C0D7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZC3H12CQ9C0D7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZC3H12CQ9C0D7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZC3H12CQ9C0D7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZC3H12CQ9C0D7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZC3H12CQ9C0D7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZC3H12CQ9C0D7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ZC3H12CQ9C0D7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ZC3H12CQ9C0D7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZC3H12CQ9C0D7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZC3H12CQ9C0D7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZC3H12CQ9C0D7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZC3H12CQ9C0D7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZC3H12CQ9C0D7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZC3H12CQ9C0D7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZC3H12CQ9C0D7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZC3H12CQ9C0D7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZC3H12CQ9C0D7 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZC3H12CQ9C0D7 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZC3H12CQ9C0D7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZC3H12CQ9C0D7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZC3H12CQ9C0D7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZC3H12CQ9C0D7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZC3H12CQ9C0D7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ZC3H12CQ9C0D7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZC3H12CQ9C0D7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZC3H12CQ9C0D7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZC3H12CQ9C0D7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZC3H12CQ9C0D7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZC3H12CQ9C0D7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ZC3H12CQ9C0D7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZC3H12CQ9C0D7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZC3H12CQ9C0D7 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZC3H12CQ9C0D7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZC3H12CQ9C0D7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ZC3H12CQ9C0D7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ZC3H12CQ9C0D7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZC3H12CQ9C0D7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZC3H12CQ9C0D7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZC3H12CQ9C0D7 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZC3H12CQ9C0D7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ZC3H12CQ9C0D7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZC3H12CQ9C0D7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZC3H12CQ9C0D7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms