Protein–RNA interactions for Protein: Q9C086

INO80B, INO80 complex subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80BQ9C086 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms