Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ0

CRNKL1, Crooked neck-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1Q9BZJ0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRNKL1Q9BZJ0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRNKL1Q9BZJ0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRNKL1Q9BZJ0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CRNKL1Q9BZJ0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRNKL1Q9BZJ0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRNKL1Q9BZJ0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRNKL1Q9BZJ0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRNKL1Q9BZJ0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRNKL1Q9BZJ0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CRNKL1Q9BZJ0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CRNKL1Q9BZJ0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CRNKL1Q9BZJ0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms