Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM55Q9BYV6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM55Q9BYV6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms