Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PCGF6Q9BYE7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PCGF6Q9BYE7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PCGF6Q9BYE7 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
PCGF6Q9BYE7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PCGF6Q9BYE7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
PCGF6Q9BYE7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PCGF6Q9BYE7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PCGF6Q9BYE7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PCGF6Q9BYE7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PCGF6Q9BYE7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PCGF6Q9BYE7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PCGF6Q9BYE7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PCGF6Q9BYE7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PCGF6Q9BYE7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PCGF6Q9BYE7 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PCGF6Q9BYE7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PCGF6Q9BYE7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PCGF6Q9BYE7 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PCGF6Q9BYE7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PCGF6Q9BYE7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PCGF6Q9BYE7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PCGF6Q9BYE7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PCGF6Q9BYE7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
PCGF6Q9BYE7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PCGF6Q9BYE7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PCGF6Q9BYE7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
PCGF6Q9BYE7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PCGF6Q9BYE7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PCGF6Q9BYE7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
PCGF6Q9BYE7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PCGF6Q9BYE7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PCGF6Q9BYE7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PCGF6Q9BYE7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
PCGF6Q9BYE7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
PCGF6Q9BYE7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
PCGF6Q9BYE7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
PCGF6Q9BYE7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
PCGF6Q9BYE7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
PCGF6Q9BYE7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PCGF6Q9BYE7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PCGF6Q9BYE7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PCGF6Q9BYE7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PCGF6Q9BYE7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PCGF6Q9BYE7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PCGF6Q9BYE7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PCGF6Q9BYE7 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PCGF6Q9BYE7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PCGF6Q9BYE7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PCGF6Q9BYE7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PCGF6Q9BYE7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PCGF6Q9BYE7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PCGF6Q9BYE7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PCGF6Q9BYE7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PCGF6Q9BYE7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PCGF6Q9BYE7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PCGF6Q9BYE7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
PCGF6Q9BYE7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PCGF6Q9BYE7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PCGF6Q9BYE7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PCGF6Q9BYE7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PCGF6Q9BYE7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PCGF6Q9BYE7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PCGF6Q9BYE7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PCGF6Q9BYE7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PCGF6Q9BYE7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PCGF6Q9BYE7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PCGF6Q9BYE7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PCGF6Q9BYE7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PCGF6Q9BYE7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PCGF6Q9BYE7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PCGF6Q9BYE7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PCGF6Q9BYE7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PCGF6Q9BYE7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PCGF6Q9BYE7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PCGF6Q9BYE7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
PCGF6Q9BYE7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PCGF6Q9BYE7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PCGF6Q9BYE7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PCGF6Q9BYE7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PCGF6Q9BYE7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
PCGF6Q9BYE7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PCGF6Q9BYE7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
PCGF6Q9BYE7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
PCGF6Q9BYE7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
PCGF6Q9BYE7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
PCGF6Q9BYE7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
PCGF6Q9BYE7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
PCGF6Q9BYE7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PCGF6Q9BYE7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PCGF6Q9BYE7 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
PCGF6Q9BYE7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PCGF6Q9BYE7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
PCGF6Q9BYE7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PCGF6Q9BYE7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PCGF6Q9BYE7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PCGF6Q9BYE7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PCGF6Q9BYE7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PCGF6Q9BYE7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PCGF6Q9BYE7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms