Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYB0

SHANK3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK3Q9BYB0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SHANK3Q9BYB0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SHANK3Q9BYB0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SHANK3Q9BYB0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SHANK3Q9BYB0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SHANK3Q9BYB0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SHANK3Q9BYB0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SHANK3Q9BYB0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SHANK3Q9BYB0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SHANK3Q9BYB0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SHANK3Q9BYB0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SHANK3Q9BYB0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SHANK3Q9BYB0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SHANK3Q9BYB0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SHANK3Q9BYB0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SHANK3Q9BYB0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SHANK3Q9BYB0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SHANK3Q9BYB0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SHANK3Q9BYB0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SHANK3Q9BYB0 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SHANK3Q9BYB0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SHANK3Q9BYB0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SHANK3Q9BYB0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SHANK3Q9BYB0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SHANK3Q9BYB0 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SHANK3Q9BYB0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SHANK3Q9BYB0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SHANK3Q9BYB0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SHANK3Q9BYB0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SHANK3Q9BYB0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SHANK3Q9BYB0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SHANK3Q9BYB0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SHANK3Q9BYB0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SHANK3Q9BYB0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SHANK3Q9BYB0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SHANK3Q9BYB0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SHANK3Q9BYB0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SHANK3Q9BYB0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SHANK3Q9BYB0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SHANK3Q9BYB0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SHANK3Q9BYB0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SHANK3Q9BYB0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SHANK3Q9BYB0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SHANK3Q9BYB0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SHANK3Q9BYB0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SHANK3Q9BYB0 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SHANK3Q9BYB0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
SHANK3Q9BYB0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SHANK3Q9BYB0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SHANK3Q9BYB0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SHANK3Q9BYB0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SHANK3Q9BYB0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SHANK3Q9BYB0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SHANK3Q9BYB0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SHANK3Q9BYB0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SHANK3Q9BYB0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SHANK3Q9BYB0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SHANK3Q9BYB0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SHANK3Q9BYB0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SHANK3Q9BYB0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SHANK3Q9BYB0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SHANK3Q9BYB0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SHANK3Q9BYB0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SHANK3Q9BYB0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SHANK3Q9BYB0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SHANK3Q9BYB0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SHANK3Q9BYB0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SHANK3Q9BYB0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SHANK3Q9BYB0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SHANK3Q9BYB0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SHANK3Q9BYB0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SHANK3Q9BYB0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SHANK3Q9BYB0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SHANK3Q9BYB0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SHANK3Q9BYB0 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SHANK3Q9BYB0 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SHANK3Q9BYB0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SHANK3Q9BYB0 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SHANK3Q9BYB0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SHANK3Q9BYB0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SHANK3Q9BYB0 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SHANK3Q9BYB0 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SHANK3Q9BYB0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SHANK3Q9BYB0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SHANK3Q9BYB0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SHANK3Q9BYB0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SHANK3Q9BYB0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SHANK3Q9BYB0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SHANK3Q9BYB0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SHANK3Q9BYB0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SHANK3Q9BYB0 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SHANK3Q9BYB0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SHANK3Q9BYB0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SHANK3Q9BYB0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SHANK3Q9BYB0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SHANK3Q9BYB0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SHANK3Q9BYB0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SHANK3Q9BYB0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SHANK3Q9BYB0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SHANK3Q9BYB0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms