Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX1

PHF7, PHD finger protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF7Q9BWX1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF7Q9BWX1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms