Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVC6

TMEM109, Transmembrane protein 109, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM109Q9BVC6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM109Q9BVC6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM109Q9BVC6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM109Q9BVC6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM109Q9BVC6 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM109Q9BVC6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM109Q9BVC6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM109Q9BVC6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM109Q9BVC6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM109Q9BVC6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM109Q9BVC6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM109Q9BVC6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM109Q9BVC6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM109Q9BVC6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM109Q9BVC6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM109Q9BVC6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM109Q9BVC6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM109Q9BVC6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM109Q9BVC6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM109Q9BVC6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM109Q9BVC6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM109Q9BVC6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM109Q9BVC6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM109Q9BVC6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM109Q9BVC6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM109Q9BVC6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM109Q9BVC6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM109Q9BVC6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM109Q9BVC6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM109Q9BVC6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM109Q9BVC6 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM109Q9BVC6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM109Q9BVC6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM109Q9BVC6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM109Q9BVC6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM109Q9BVC6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM109Q9BVC6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM109Q9BVC6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM109Q9BVC6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM109Q9BVC6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM109Q9BVC6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM109Q9BVC6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM109Q9BVC6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM109Q9BVC6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM109Q9BVC6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM109Q9BVC6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM109Q9BVC6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM109Q9BVC6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM109Q9BVC6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM109Q9BVC6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM109Q9BVC6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM109Q9BVC6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM109Q9BVC6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM109Q9BVC6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM109Q9BVC6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM109Q9BVC6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM109Q9BVC6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM109Q9BVC6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM109Q9BVC6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM109Q9BVC6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM109Q9BVC6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM109Q9BVC6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM109Q9BVC6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM109Q9BVC6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM109Q9BVC6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM109Q9BVC6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM109Q9BVC6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM109Q9BVC6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM109Q9BVC6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM109Q9BVC6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM109Q9BVC6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM109Q9BVC6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM109Q9BVC6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM109Q9BVC6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TMEM109Q9BVC6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TMEM109Q9BVC6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM109Q9BVC6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM109Q9BVC6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM109Q9BVC6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM109Q9BVC6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM109Q9BVC6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM109Q9BVC6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM109Q9BVC6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM109Q9BVC6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM109Q9BVC6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM109Q9BVC6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM109Q9BVC6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM109Q9BVC6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM109Q9BVC6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM109Q9BVC6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM109Q9BVC6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM109Q9BVC6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM109Q9BVC6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM109Q9BVC6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM109Q9BVC6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM109Q9BVC6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM109Q9BVC6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM109Q9BVC6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM109Q9BVC6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM109Q9BVC6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms