Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTU6

PI4K2A, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4K2AQ9BTU6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PI4K2AQ9BTU6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PI4K2AQ9BTU6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PI4K2AQ9BTU6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PI4K2AQ9BTU6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PI4K2AQ9BTU6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PI4K2AQ9BTU6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PI4K2AQ9BTU6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PI4K2AQ9BTU6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PI4K2AQ9BTU6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PI4K2AQ9BTU6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PI4K2AQ9BTU6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PI4K2AQ9BTU6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PI4K2AQ9BTU6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PI4K2AQ9BTU6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PI4K2AQ9BTU6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PI4K2AQ9BTU6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PI4K2AQ9BTU6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PI4K2AQ9BTU6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PI4K2AQ9BTU6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PI4K2AQ9BTU6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PI4K2AQ9BTU6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PI4K2AQ9BTU6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PI4K2AQ9BTU6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PI4K2AQ9BTU6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PI4K2AQ9BTU6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PI4K2AQ9BTU6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PI4K2AQ9BTU6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PI4K2AQ9BTU6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PI4K2AQ9BTU6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PI4K2AQ9BTU6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PI4K2AQ9BTU6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PI4K2AQ9BTU6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PI4K2AQ9BTU6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PI4K2AQ9BTU6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PI4K2AQ9BTU6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PI4K2AQ9BTU6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PI4K2AQ9BTU6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PI4K2AQ9BTU6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PI4K2AQ9BTU6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PI4K2AQ9BTU6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PI4K2AQ9BTU6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PI4K2AQ9BTU6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PI4K2AQ9BTU6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PI4K2AQ9BTU6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PI4K2AQ9BTU6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PI4K2AQ9BTU6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PI4K2AQ9BTU6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PI4K2AQ9BTU6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PI4K2AQ9BTU6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PI4K2AQ9BTU6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PI4K2AQ9BTU6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PI4K2AQ9BTU6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PI4K2AQ9BTU6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PI4K2AQ9BTU6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PI4K2AQ9BTU6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PI4K2AQ9BTU6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PI4K2AQ9BTU6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PI4K2AQ9BTU6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PI4K2AQ9BTU6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PI4K2AQ9BTU6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PI4K2AQ9BTU6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PI4K2AQ9BTU6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PI4K2AQ9BTU6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PI4K2AQ9BTU6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PI4K2AQ9BTU6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PI4K2AQ9BTU6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PI4K2AQ9BTU6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PI4K2AQ9BTU6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PI4K2AQ9BTU6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PI4K2AQ9BTU6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PI4K2AQ9BTU6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PI4K2AQ9BTU6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PI4K2AQ9BTU6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PI4K2AQ9BTU6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PI4K2AQ9BTU6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PI4K2AQ9BTU6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PI4K2AQ9BTU6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PI4K2AQ9BTU6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PI4K2AQ9BTU6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PI4K2AQ9BTU6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PI4K2AQ9BTU6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PI4K2AQ9BTU6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PI4K2AQ9BTU6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PI4K2AQ9BTU6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PI4K2AQ9BTU6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PI4K2AQ9BTU6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PI4K2AQ9BTU6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PI4K2AQ9BTU6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PI4K2AQ9BTU6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PI4K2AQ9BTU6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PI4K2AQ9BTU6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PI4K2AQ9BTU6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PI4K2AQ9BTU6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PI4K2AQ9BTU6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PI4K2AQ9BTU6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PI4K2AQ9BTU6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PI4K2AQ9BTU6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PI4K2AQ9BTU6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PI4K2AQ9BTU6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms