Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TMEM175Q9BSA9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM175Q9BSA9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM175Q9BSA9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM175Q9BSA9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM175Q9BSA9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM175Q9BSA9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM175Q9BSA9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM175Q9BSA9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM175Q9BSA9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM175Q9BSA9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM175Q9BSA9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM175Q9BSA9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM175Q9BSA9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM175Q9BSA9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM175Q9BSA9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM175Q9BSA9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM175Q9BSA9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM175Q9BSA9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM175Q9BSA9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM175Q9BSA9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM175Q9BSA9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM175Q9BSA9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM175Q9BSA9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM175Q9BSA9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM175Q9BSA9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM175Q9BSA9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM175Q9BSA9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM175Q9BSA9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM175Q9BSA9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM175Q9BSA9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM175Q9BSA9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM175Q9BSA9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM175Q9BSA9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM175Q9BSA9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM175Q9BSA9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM175Q9BSA9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM175Q9BSA9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM175Q9BSA9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM175Q9BSA9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM175Q9BSA9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM175Q9BSA9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM175Q9BSA9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM175Q9BSA9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM175Q9BSA9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM175Q9BSA9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM175Q9BSA9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM175Q9BSA9 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM175Q9BSA9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM175Q9BSA9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM175Q9BSA9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM175Q9BSA9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms