Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS26

ERP44, Endoplasmic reticulum resident protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERP44Q9BS26 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERP44Q9BS26 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERP44Q9BS26 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERP44Q9BS26 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERP44Q9BS26 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERP44Q9BS26 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERP44Q9BS26 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERP44Q9BS26 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERP44Q9BS26 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERP44Q9BS26 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERP44Q9BS26 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERP44Q9BS26 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERP44Q9BS26 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERP44Q9BS26 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERP44Q9BS26 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERP44Q9BS26 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERP44Q9BS26 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERP44Q9BS26 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERP44Q9BS26 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERP44Q9BS26 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERP44Q9BS26 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERP44Q9BS26 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERP44Q9BS26 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERP44Q9BS26 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERP44Q9BS26 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERP44Q9BS26 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERP44Q9BS26 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERP44Q9BS26 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERP44Q9BS26 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERP44Q9BS26 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERP44Q9BS26 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERP44Q9BS26 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERP44Q9BS26 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERP44Q9BS26 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERP44Q9BS26 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms