Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms