Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms