Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR77

CCDC77, Coiled-coil domain-containing protein 77, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC77Q9BR77 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC77Q9BR77 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 460.7 ms