Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ7

RTP3, Receptor-transporting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP3Q9BQQ7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTP3Q9BQQ7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTP3Q9BQQ7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTP3Q9BQQ7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTP3Q9BQQ7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTP3Q9BQQ7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTP3Q9BQQ7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTP3Q9BQQ7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTP3Q9BQQ7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTP3Q9BQQ7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTP3Q9BQQ7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTP3Q9BQQ7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RTP3Q9BQQ7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RTP3Q9BQQ7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RTP3Q9BQQ7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms