Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMIM7Q9BQ49 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM7Q9BQ49 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1008.3 ms