Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ04

RBM4B, RNA-binding protein 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM4BQ9BQ04 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RBM4BQ9BQ04 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RBM4BQ9BQ04 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RBM4BQ9BQ04 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
RBM4BQ9BQ04 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RBM4BQ9BQ04 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RBM4BQ9BQ04 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RBM4BQ9BQ04 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RBM4BQ9BQ04 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RBM4BQ9BQ04 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RBM4BQ9BQ04 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RBM4BQ9BQ04 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RBM4BQ9BQ04 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RBM4BQ9BQ04 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RBM4BQ9BQ04 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RBM4BQ9BQ04 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RBM4BQ9BQ04 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RBM4BQ9BQ04 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RBM4BQ9BQ04 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RBM4BQ9BQ04 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RBM4BQ9BQ04 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RBM4BQ9BQ04 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RBM4BQ9BQ04 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RBM4BQ9BQ04 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RBM4BQ9BQ04 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RBM4BQ9BQ04 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RBM4BQ9BQ04 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RBM4BQ9BQ04 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RBM4BQ9BQ04 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RBM4BQ9BQ04 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RBM4BQ9BQ04 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
RBM4BQ9BQ04 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RBM4BQ9BQ04 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RBM4BQ9BQ04 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
RBM4BQ9BQ04 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RBM4BQ9BQ04 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RBM4BQ9BQ04 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RBM4BQ9BQ04 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RBM4BQ9BQ04 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RBM4BQ9BQ04 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RBM4BQ9BQ04 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RBM4BQ9BQ04 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RBM4BQ9BQ04 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RBM4BQ9BQ04 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RBM4BQ9BQ04 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RBM4BQ9BQ04 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RBM4BQ9BQ04 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
RBM4BQ9BQ04 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
RBM4BQ9BQ04 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RBM4BQ9BQ04 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RBM4BQ9BQ04 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RBM4BQ9BQ04 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RBM4BQ9BQ04 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RBM4BQ9BQ04 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RBM4BQ9BQ04 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RBM4BQ9BQ04 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RBM4BQ9BQ04 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms