Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPS8Q99627 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms