Protein–RNA interactions for Protein: Q99618

CDCA3, Cell division cycle-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA3Q99618 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDCA3Q99618 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms