Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
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CDRT15Q96T59 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
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CDRT15Q96T59 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CDRT15Q96T59 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDRT15Q96T59 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDRT15Q96T59 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDRT15Q96T59 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDRT15Q96T59 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDRT15Q96T59 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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