Protein–RNA interactions for Protein: Q96T23

RSF1, Remodeling and spacing factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSF1Q96T23 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
RSF1Q96T23 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
RSF1Q96T23 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
RSF1Q96T23 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
RSF1Q96T23 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
RSF1Q96T23 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
RSF1Q96T23 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
RSF1Q96T23 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC38.38■■■■□ 3.74
RSF1Q96T23 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
RSF1Q96T23 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
RSF1Q96T23 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
RSF1Q96T23 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
RSF1Q96T23 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
RSF1Q96T23 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC38.38■■■■□ 3.73
RSF1Q96T23 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
RSF1Q96T23 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
RSF1Q96T23 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
RSF1Q96T23 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
RSF1Q96T23 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
RSF1Q96T23 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
RSF1Q96T23 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
RSF1Q96T23 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
RSF1Q96T23 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
RSF1Q96T23 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
RSF1Q96T23 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
RSF1Q96T23 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
RSF1Q96T23 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
RSF1Q96T23 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
RSF1Q96T23 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
RSF1Q96T23 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
RSF1Q96T23 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
RSF1Q96T23 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
RSF1Q96T23 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
RSF1Q96T23 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
RSF1Q96T23 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
RSF1Q96T23 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
RSF1Q96T23 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
RSF1Q96T23 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
RSF1Q96T23 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
RSF1Q96T23 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
RSF1Q96T23 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
RSF1Q96T23 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC38.34■■■■□ 3.73
RSF1Q96T23 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
RSF1Q96T23 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
RSF1Q96T23 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC38.34■■■■□ 3.73
RSF1Q96T23 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
RSF1Q96T23 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
RSF1Q96T23 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
RSF1Q96T23 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
RSF1Q96T23 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
RSF1Q96T23 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
RSF1Q96T23 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
RSF1Q96T23 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
RSF1Q96T23 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
RSF1Q96T23 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
RSF1Q96T23 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
RSF1Q96T23 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
RSF1Q96T23 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC38.32■■■■□ 3.73
RSF1Q96T23 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.72
RSF1Q96T23 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.72
RSF1Q96T23 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC38.32■■■■□ 3.72
RSF1Q96T23 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
RSF1Q96T23 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC38.31■■■■□ 3.72
RSF1Q96T23 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
RSF1Q96T23 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
RSF1Q96T23 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
RSF1Q96T23 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
RSF1Q96T23 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
RSF1Q96T23 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
RSF1Q96T23 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
RSF1Q96T23 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
RSF1Q96T23 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC38.3■■■■□ 3.72
RSF1Q96T23 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC38.3■■■■□ 3.72
RSF1Q96T23 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
RSF1Q96T23 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
RSF1Q96T23 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
RSF1Q96T23 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
RSF1Q96T23 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
RSF1Q96T23 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC38.3■■■■□ 3.72
RSF1Q96T23 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
RSF1Q96T23 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
RSF1Q96T23 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
RSF1Q96T23 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC38.29■■■■□ 3.72
RSF1Q96T23 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
RSF1Q96T23 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC38.29■■■■□ 3.72
RSF1Q96T23 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
RSF1Q96T23 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
RSF1Q96T23 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
RSF1Q96T23 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
RSF1Q96T23 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
RSF1Q96T23 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
RSF1Q96T23 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
RSF1Q96T23 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
RSF1Q96T23 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
RSF1Q96T23 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
RSF1Q96T23 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
RSF1Q96T23 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
RSF1Q96T23 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
RSF1Q96T23 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC38.28■■■■□ 3.72
RSF1Q96T23 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms