Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSPAN18Q96SJ8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms