Protein–RNA interactions for Protein: Q96SF2

CCT8L2, T-complex protein 1 subunit theta-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L2Q96SF2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCT8L2Q96SF2 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCT8L2Q96SF2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCT8L2Q96SF2 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCT8L2Q96SF2 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCT8L2Q96SF2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCT8L2Q96SF2 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCT8L2Q96SF2 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCT8L2Q96SF2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCT8L2Q96SF2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCT8L2Q96SF2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCT8L2Q96SF2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCT8L2Q96SF2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCT8L2Q96SF2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCT8L2Q96SF2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCT8L2Q96SF2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCT8L2Q96SF2 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCT8L2Q96SF2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCT8L2Q96SF2 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCT8L2Q96SF2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCT8L2Q96SF2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCT8L2Q96SF2 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCT8L2Q96SF2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCT8L2Q96SF2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCT8L2Q96SF2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCT8L2Q96SF2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCT8L2Q96SF2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCT8L2Q96SF2 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCT8L2Q96SF2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCT8L2Q96SF2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCT8L2Q96SF2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCT8L2Q96SF2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCT8L2Q96SF2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCT8L2Q96SF2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCT8L2Q96SF2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCT8L2Q96SF2 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCT8L2Q96SF2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms