Protein–RNA interactions for Protein: Q96QH2

PRAM1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAM1Q96QH2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PRAM1Q96QH2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PRAM1Q96QH2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PRAM1Q96QH2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
PRAM1Q96QH2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
PRAM1Q96QH2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRAM1Q96QH2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRAM1Q96QH2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRAM1Q96QH2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRAM1Q96QH2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRAM1Q96QH2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRAM1Q96QH2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRAM1Q96QH2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRAM1Q96QH2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PRAM1Q96QH2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PRAM1Q96QH2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PRAM1Q96QH2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PRAM1Q96QH2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PRAM1Q96QH2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PRAM1Q96QH2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PRAM1Q96QH2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PRAM1Q96QH2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PRAM1Q96QH2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PRAM1Q96QH2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PRAM1Q96QH2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PRAM1Q96QH2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
PRAM1Q96QH2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRAM1Q96QH2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRAM1Q96QH2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRAM1Q96QH2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRAM1Q96QH2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRAM1Q96QH2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRAM1Q96QH2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRAM1Q96QH2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRAM1Q96QH2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRAM1Q96QH2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRAM1Q96QH2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRAM1Q96QH2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRAM1Q96QH2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRAM1Q96QH2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRAM1Q96QH2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRAM1Q96QH2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRAM1Q96QH2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRAM1Q96QH2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRAM1Q96QH2 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
PRAM1Q96QH2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
PRAM1Q96QH2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRAM1Q96QH2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRAM1Q96QH2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PRAM1Q96QH2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PRAM1Q96QH2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PRAM1Q96QH2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PRAM1Q96QH2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PRAM1Q96QH2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PRAM1Q96QH2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PRAM1Q96QH2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PRAM1Q96QH2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
PRAM1Q96QH2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PRAM1Q96QH2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PRAM1Q96QH2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
PRAM1Q96QH2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PRAM1Q96QH2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRAM1Q96QH2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRAM1Q96QH2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRAM1Q96QH2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRAM1Q96QH2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRAM1Q96QH2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRAM1Q96QH2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRAM1Q96QH2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRAM1Q96QH2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRAM1Q96QH2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRAM1Q96QH2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRAM1Q96QH2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
PRAM1Q96QH2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRAM1Q96QH2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRAM1Q96QH2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRAM1Q96QH2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRAM1Q96QH2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRAM1Q96QH2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRAM1Q96QH2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRAM1Q96QH2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRAM1Q96QH2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRAM1Q96QH2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRAM1Q96QH2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRAM1Q96QH2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
PRAM1Q96QH2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRAM1Q96QH2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRAM1Q96QH2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRAM1Q96QH2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRAM1Q96QH2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRAM1Q96QH2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRAM1Q96QH2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRAM1Q96QH2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRAM1Q96QH2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRAM1Q96QH2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PRAM1Q96QH2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PRAM1Q96QH2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PRAM1Q96QH2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PRAM1Q96QH2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PRAM1Q96QH2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms