Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SORCS2Q96PQ0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SORCS2Q96PQ0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SORCS2Q96PQ0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SORCS2Q96PQ0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SORCS2Q96PQ0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SORCS2Q96PQ0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SORCS2Q96PQ0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SORCS2Q96PQ0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SORCS2Q96PQ0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SORCS2Q96PQ0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SORCS2Q96PQ0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SORCS2Q96PQ0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SORCS2Q96PQ0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SORCS2Q96PQ0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SORCS2Q96PQ0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SORCS2Q96PQ0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SORCS2Q96PQ0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SORCS2Q96PQ0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SORCS2Q96PQ0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SORCS2Q96PQ0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SORCS2Q96PQ0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SORCS2Q96PQ0 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SORCS2Q96PQ0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SORCS2Q96PQ0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SORCS2Q96PQ0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SORCS2Q96PQ0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SORCS2Q96PQ0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SORCS2Q96PQ0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SORCS2Q96PQ0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SORCS2Q96PQ0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SORCS2Q96PQ0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SORCS2Q96PQ0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SORCS2Q96PQ0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SORCS2Q96PQ0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SORCS2Q96PQ0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SORCS2Q96PQ0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SORCS2Q96PQ0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SORCS2Q96PQ0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SORCS2Q96PQ0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SORCS2Q96PQ0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SORCS2Q96PQ0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SORCS2Q96PQ0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SORCS2Q96PQ0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SORCS2Q96PQ0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SORCS2Q96PQ0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SORCS2Q96PQ0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SORCS2Q96PQ0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SORCS2Q96PQ0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SORCS2Q96PQ0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SORCS2Q96PQ0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SORCS2Q96PQ0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SORCS2Q96PQ0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SORCS2Q96PQ0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SORCS2Q96PQ0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SORCS2Q96PQ0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SORCS2Q96PQ0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SORCS2Q96PQ0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SORCS2Q96PQ0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SORCS2Q96PQ0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SORCS2Q96PQ0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SORCS2Q96PQ0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SORCS2Q96PQ0 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SORCS2Q96PQ0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SORCS2Q96PQ0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SORCS2Q96PQ0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SORCS2Q96PQ0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SORCS2Q96PQ0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SORCS2Q96PQ0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SORCS2Q96PQ0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SORCS2Q96PQ0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SORCS2Q96PQ0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SORCS2Q96PQ0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SORCS2Q96PQ0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SORCS2Q96PQ0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SORCS2Q96PQ0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SORCS2Q96PQ0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SORCS2Q96PQ0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SORCS2Q96PQ0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SORCS2Q96PQ0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SORCS2Q96PQ0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SORCS2Q96PQ0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SORCS2Q96PQ0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SORCS2Q96PQ0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SORCS2Q96PQ0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SORCS2Q96PQ0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SORCS2Q96PQ0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SORCS2Q96PQ0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SORCS2Q96PQ0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SORCS2Q96PQ0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SORCS2Q96PQ0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SORCS2Q96PQ0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SORCS2Q96PQ0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SORCS2Q96PQ0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SORCS2Q96PQ0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SORCS2Q96PQ0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SORCS2Q96PQ0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SORCS2Q96PQ0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SORCS2Q96PQ0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SORCS2Q96PQ0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms