Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GBP4Q96PP9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GBP4Q96PP9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GBP4Q96PP9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GBP4Q96PP9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GBP4Q96PP9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GBP4Q96PP9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GBP4Q96PP9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GBP4Q96PP9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GBP4Q96PP9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GBP4Q96PP9 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GBP4Q96PP9 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GBP4Q96PP9 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GBP4Q96PP9 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GBP4Q96PP9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GBP4Q96PP9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GBP4Q96PP9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GBP4Q96PP9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GBP4Q96PP9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GBP4Q96PP9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GBP4Q96PP9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GBP4Q96PP9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GBP4Q96PP9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GBP4Q96PP9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GBP4Q96PP9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GBP4Q96PP9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GBP4Q96PP9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GBP4Q96PP9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GBP4Q96PP9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GBP4Q96PP9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GBP4Q96PP9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GBP4Q96PP9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GBP4Q96PP9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GBP4Q96PP9 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GBP4Q96PP9 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GBP4Q96PP9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GBP4Q96PP9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GBP4Q96PP9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GBP4Q96PP9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GBP4Q96PP9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GBP4Q96PP9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GBP4Q96PP9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GBP4Q96PP9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GBP4Q96PP9 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GBP4Q96PP9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GBP4Q96PP9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GBP4Q96PP9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GBP4Q96PP9 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GBP4Q96PP9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GBP4Q96PP9 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GBP4Q96PP9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GBP4Q96PP9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GBP4Q96PP9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GBP4Q96PP9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GBP4Q96PP9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GBP4Q96PP9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GBP4Q96PP9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GBP4Q96PP9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GBP4Q96PP9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GBP4Q96PP9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GBP4Q96PP9 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GBP4Q96PP9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GBP4Q96PP9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GBP4Q96PP9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GBP4Q96PP9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GBP4Q96PP9 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GBP4Q96PP9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GBP4Q96PP9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GBP4Q96PP9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GBP4Q96PP9 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GBP4Q96PP9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GBP4Q96PP9 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GBP4Q96PP9 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GBP4Q96PP9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GBP4Q96PP9 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GBP4Q96PP9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GBP4Q96PP9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GBP4Q96PP9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GBP4Q96PP9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GBP4Q96PP9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GBP4Q96PP9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GBP4Q96PP9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GBP4Q96PP9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GBP4Q96PP9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GBP4Q96PP9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GBP4Q96PP9 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GBP4Q96PP9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GBP4Q96PP9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GBP4Q96PP9 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GBP4Q96PP9 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GBP4Q96PP9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GBP4Q96PP9 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GBP4Q96PP9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GBP4Q96PP9 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GBP4Q96PP9 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GBP4Q96PP9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GBP4Q96PP9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GBP4Q96PP9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GBP4Q96PP9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GBP4Q96PP9 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms