Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE7

MCEE, Methylmalonyl-CoA epimerase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCEEQ96PE7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCEEQ96PE7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCEEQ96PE7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCEEQ96PE7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MCEEQ96PE7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCEEQ96PE7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCEEQ96PE7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MCEEQ96PE7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MCEEQ96PE7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCEEQ96PE7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCEEQ96PE7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCEEQ96PE7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCEEQ96PE7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCEEQ96PE7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCEEQ96PE7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCEEQ96PE7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCEEQ96PE7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCEEQ96PE7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCEEQ96PE7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCEEQ96PE7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCEEQ96PE7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCEEQ96PE7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MCEEQ96PE7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCEEQ96PE7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCEEQ96PE7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCEEQ96PE7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MCEEQ96PE7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MCEEQ96PE7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCEEQ96PE7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCEEQ96PE7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCEEQ96PE7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCEEQ96PE7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCEEQ96PE7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCEEQ96PE7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCEEQ96PE7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCEEQ96PE7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCEEQ96PE7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCEEQ96PE7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MCEEQ96PE7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MCEEQ96PE7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCEEQ96PE7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCEEQ96PE7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCEEQ96PE7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCEEQ96PE7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCEEQ96PE7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCEEQ96PE7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCEEQ96PE7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCEEQ96PE7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCEEQ96PE7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCEEQ96PE7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCEEQ96PE7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MCEEQ96PE7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCEEQ96PE7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCEEQ96PE7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCEEQ96PE7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCEEQ96PE7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCEEQ96PE7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCEEQ96PE7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCEEQ96PE7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCEEQ96PE7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCEEQ96PE7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCEEQ96PE7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCEEQ96PE7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCEEQ96PE7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCEEQ96PE7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCEEQ96PE7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCEEQ96PE7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCEEQ96PE7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCEEQ96PE7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCEEQ96PE7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCEEQ96PE7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCEEQ96PE7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCEEQ96PE7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MCEEQ96PE7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCEEQ96PE7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCEEQ96PE7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCEEQ96PE7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCEEQ96PE7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCEEQ96PE7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCEEQ96PE7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCEEQ96PE7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCEEQ96PE7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MCEEQ96PE7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MCEEQ96PE7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MCEEQ96PE7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MCEEQ96PE7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCEEQ96PE7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms