Protein–RNA interactions for Protein: Q96NU1

SAMD11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD11Q96NU1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAMD11Q96NU1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMD11Q96NU1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMD11Q96NU1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMD11Q96NU1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMD11Q96NU1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMD11Q96NU1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMD11Q96NU1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMD11Q96NU1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMD11Q96NU1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMD11Q96NU1 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMD11Q96NU1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMD11Q96NU1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMD11Q96NU1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMD11Q96NU1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMD11Q96NU1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMD11Q96NU1 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMD11Q96NU1 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMD11Q96NU1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMD11Q96NU1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMD11Q96NU1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMD11Q96NU1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMD11Q96NU1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMD11Q96NU1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMD11Q96NU1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMD11Q96NU1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAMD11Q96NU1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAMD11Q96NU1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SAMD11Q96NU1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAMD11Q96NU1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAMD11Q96NU1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAMD11Q96NU1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms