Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC43Q96MW1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms